O futebol goiano terá três representantes na edição 2017 da Copa do Brasil Sub-20. Além de Atlético e Vila Nova que já estavam garantidos, o Goiás Esporte Clube é o terceiro clube do estado a garantir vaga na competição. Tudo por conta da desistência do Brasil de Pelotas que comunicou a Confederação Brasileira de Futebol sua desistência.
As vagas para a Copa do Brasil Sub-20 são dos 20 clubes que disputam a Série A do Campeonato Brasileiro no ano anterior e os 12 melhores colocados na Série B. Com o Verdão terminou na 13ª posição, ele estava fora da disputa.
O primeiro adversário do Goiás será o Atlético Paranaense com o jogo de ida em Goiânia e a volta na cidade de Curitiba. O Vila Nova vai enfrentar o São Paulo e o Atlético Clube Goianiense encara o Atlético Mineiro, com os jogos de ida em Goiânia e a volta na casa do adversário.